RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 MAXP61244 160 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PAGE2BQ5JRK9 111 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 WSCD1Q658N2 575 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 THAP5Q7Z6K1 395 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 OSCP1Q8WVF1 389 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NTAN1Q96AB6 310 aa13.45□□□□□ -0.26
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SH3BP1-206ENST00000469947 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.263e-59■■■■■ 48
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SH3BP1-206ENST00000469947 KCTD3Q9Y597 815 aa13.45□□□□□ -0.26
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SH3BP1-206ENST00000469947 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 OR4D1Q15615 310 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ARL13BQ3SXY8 428 aa13.45□□□□□ -0.26
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SH3BP1-206ENST00000469947 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
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SH3BP1-206ENST00000469947 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
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SH3BP1-206ENST00000469947 ALDH3A2P51648 485 aa13.44□□□□□ -0.26
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SH3BP1-206ENST00000469947 ACOX2Q99424 681 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 OSMRQ99650 979 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TRMOQ9BU70 441 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TPK1Q9H3S4 243 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
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SH3BP1-206ENST00000469947 PDE10AQ9Y233 779 aa13.44□□□□□ -0.26
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