RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	CXADR	P78310	365 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	ADCY2	Q08462	1091 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	XRCC4	Q13426	336 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	KIR2DS5	Q14953	304 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	XKR5	Q6UX68	686 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIM74	Q86UV6	250 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	RFX6	Q8HWS3	928 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC39A7	Q92504	469 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	AGAP3	Q96P47	875 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	FCRL5	Q96RD9	977 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF711	Q9Y462	761 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		12.22	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	LILRA5	A6NI73	299 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307		B4E171	279 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	C9orf172	C9J069	976 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	GRID2	O43424	1007 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	VEGFD	O43915	354 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	PPFIA2	O75334	1257 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	EML2	O95834	649 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	APOC2	P02655	101 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	JMJD7	P0C870	316 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	F3	P13726	295 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	BPI	P17213	487 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	CSF2RB	P32927	897 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	ETV5	P41161	510 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	TSPAN7	P41732	249 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	GALNT3	Q14435	633 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	MAP9	Q49MG5	647 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	DOK6	Q6PKX4	331 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	GLYATL1	Q969I3	302 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	DDA1	Q9BW61	102 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIM5	Q9C035	493 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	HACD3	Q9P035	362 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PGAP2-215	ENST00000469307	INPP4B	O15327	924 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	PJA2	O43164	708 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNJ13	O60928	360 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	HGF	P14210	728 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	HLA-DPA1	P20036	260 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	ALDH4A1	P30038	563 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	ARSD	P51689	593 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	MPP3	Q13368	585 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF567	Q8N184	647 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	BMPER	Q8N8U9	685 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	P3H4	Q92791	437 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	TAAR9	Q96RI9	348 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	CEP41	Q9BYV8	373 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PGAP2-215	ENST00000469307	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms