RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467996.1

RNF13-208, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 767 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-208	ENST00000467996	TEAD1	P28347	426 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	GABRB3	P28472	473 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	PML	P29590	882 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	GP5	P40197	560 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	MSH2	P43246	934 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ABCG1	P45844	678 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	TTPA	P49638	278 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	PNCK	Q6P2M8	343 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	GALNT7	Q86SF2	657 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	GLYATL1	Q969I3	302 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ZBTB9	Q96C00	473 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	RBBP8	Q99708	897 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	EBF2	Q9HAK2	575 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	EURL	Q9NYK6	297 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	METTL12	A8MUP2	240 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	RASGRF2	O14827	1237 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	NDUFS3	O75489	264 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	HAUS5	O94927	633 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	AHSG	P02765	367 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	CD151	P48509	253 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	LIMK2	P53671	638 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ITIH4	Q14624	930 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	KRT71	Q3SY84	523 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	GRTP1	Q5TC63	336 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	CNST	Q6PJW8	725 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	TDRP	Q86YL5	185 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	RBFA	Q8N0V3	343 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	DEFB119	Q8N690	84 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	SNX19	Q92543	992 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	TCF12	Q99081	682 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	TTC1	Q99614	292 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	COPS8	Q99627	209 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	BOC	Q9BWV1	1114 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	TTC28	Q96AY4	2481 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996		A0A1W2PPC4	97 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	MEI4	A8MW99	385 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	AGPS	O00116	658 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	FPGT	O14772	594 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	PFDN6	O15212	129 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	OR1I1	O60431	355 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	GPR37L1	O60883	481 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	CDH16	O75309	829 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	MTX2	O75431	263 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	AKT1	P31749	480 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	AKT2	P31751	481 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	TRIM23	P36406	574 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	NUDT1	P36639	197 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	PTGER3	P43115	390 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	SERPINB9	P50453	376 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNF13-208	ENST00000467996	CLDN2	P57739	230 aa		11.73	□□□□□ -0.53

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