RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 CA14Q9ULX7 337 aa18.51■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 PRNPP04156 253 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 GRK2P25098 689 aa18.51■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 PSMD8P48556 350 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 AQP5P55064 265 aa18.51■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 USP45Q70EL2 814 aa18.51■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa18.51■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 B2RBV5 119 aa18.5■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 COL9A1P20849 921 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 GMPRP36959 345 aa18.5■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 LYSMD1Q96S90 227 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 HACD3Q9P035 362 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 A0A1W2PQF6 199 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 TSPAN11A1L157 253 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 UPK3BL1B0FP48 263 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 SLC7A4O43246 635 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CIB2O75838 187 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 BPIP17213 487 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 DRD1P21728 446 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 NTSR1P30989 418 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 XIAPP98170 497 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CCINQ13939 588 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CNTN4Q8IWV2 1026 aa18.49■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 OR4L1Q8NH43 312 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa18.49■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 FAM50BQ9Y247 325 aa18.49■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 PLIN3O60664 434 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 TM7SF2O76062 418 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 KLHL2O95198 593 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 SERPINE1P05121 402 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 ENO1P06733 434 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 AOC1P19801 751 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 MC4RP32245 332 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 GP5P40197 560 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 COPAP53621 1224 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 SATB1Q01826 763 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CES4AQ5XG92 561 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CNSTQ6PJW8 725 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 FAM151BQ6UXP7 276 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 GPR26Q8NDV2 337 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 NAT14Q8WUY8 206 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CPNE1Q99829 537 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 MCMBPQ9BTE3 642 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CAB39LQ9H9S4 337 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 IL26Q9NPH9 171 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 ARMCX1Q9P291 453 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 TXNDC16Q9P2K2 825 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 DKK3Q9UBP4 350 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 SERGEFQ9UGK8 458 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CD84Q9UIB8 345 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 DUSP12Q9UNI6 340 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 MID1O15344 667 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 ITGA2BP08514 1039 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 C1SP09871 688 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 PSMA3P25788 255 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 LAMB3Q13751 1172 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 GRTP1Q5TC63 336 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa18.48■□□□□ 0.55
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