RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 RARGP13631 454 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CYP11B1P15538 503 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 IFNA8P32881 189 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PBX1P40424 430 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 STAT1P42224 750 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TNFRSF4P43489 277 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ARSDP51689 593 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ARFIP1P53367 373 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PDCLQ13371 301 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SCARB2Q14108 478 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 DOC2AQ14183 400 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 NR1I3Q14994 352 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB12Q6IQ22 244 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 MSANTD2Q6P1R3 559 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PCSK4Q6UW60 755 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF677Q86XU0 584 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CDH26Q8IXH8 852 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 HAUS1Q96CS2 278 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 HSFY1Q96LI6 401 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CCDC77Q9BR77 488 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 STK33Q9BYT3 514 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 LHX5Q9H2C1 402 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PRORYQ9H606 182 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GAREM1Q9H706 876 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TM7SF3Q9NS93 570 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa7.32□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 MEI4A8MW99 385 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 E5RJQ4 531 aa7.31□□□□□ -1.24
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RPUSD3-212ENST00000466141 PIK3R2O00459 728 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 NDUFS2O75306 463 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 TULP3O75386 442 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ATP5HO75947 161 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 KLHL18O94889 574 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 HSPA4LO95757 839 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CRYZL1O95825 349 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ADH1CP00326 375 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PRLP01236 227 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 APOA4P06727 396 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PF4V1P10720 104 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 COL6A2P12110 1019 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 LCP1P13796 627 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 GNSP15586 552 aa7.31□□□□□ -1.24
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RPUSD3-212ENST00000466141 RAB14P61106 215 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 CENPCQ03188 943 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PTK2Q05397 1052 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 LGALS3BPQ08380 585 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 KCNAB2Q13303 367 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 RIPK1Q13546 671 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 STAT4Q14765 748 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ACAP2Q15057 778 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 HLA-BQ31612 363 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 MMEL1Q495T6 779 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PTPN20Q4JDL3 420 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 ODF2Q5BJF6 829 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 SHEQ5VZ18 495 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD3-212ENST00000466141 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.31□□□□□ -1.24
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