RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 C22orf39Q6P5X5 142 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TLDC1Q6P9B6 456 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CUZD1Q86UP6 607 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CAMK1DQ8IU85 385 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LEMD2Q8NC56 503 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 OR2AP1Q8NGE2 309 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DTX3LQ8TDB6 740 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FRS2Q8WU20 508 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 POF1BQ8WVV4 589 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RMDN1Q96DB5 314 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SGF29Q96ES7 293 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FAR2Q96K12 515 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SCYL1Q96KG9 808 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TSNARE1Q96NA8 513 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC3BQ96PB8 259 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GPR21Q99679 349 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CORO1BQ9BR76 489 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RTKNQ9BST9 563 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ERVK-6Q9BXR3 956 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 ALG9Q9H6U8 611 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 IL26Q9NPH9 171 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TLR9Q9NR96 1032 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 WDR70Q9NW82 654 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SLC7A8Q9UHI5 535 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF225Q9UK10 706 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DHRS7Q9Y394 339 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 COL4A2P08572 1712 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TRPC5OSA6NMA1 111 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MEI4A8MW99 385 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 E9PBE3 544 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 UBXN8O00124 270 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CDC7O00311 574 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PPP6CO00743 305 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 GYG2O15488 501 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GPR39O43194 453 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DCXO43602 365 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL41O60662 606 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ENTPD5O75356 428 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ECI2O75521 394 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 IGSF6O95976 241 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ARSAP15289 507 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 BPIP17213 487 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CEBPBP17676 345 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PTPN2P17706 415 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GKP32189 559 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CTNNB1P35222 781 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PGM1P36871 562 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CPA2P48052 419 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 COPAP53621 1224 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SLC12A2P55011 1212 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MTTPP55157 894 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ACTR3P61158 418 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NAA20P61599 178 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SH3BP2P78314 561 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NTHL1P78549 312 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 KDSRQ06136 332 aa5.6□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TSNQ15631 228 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MYLK3Q32MK0 819 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 XKR7Q5GH72 579 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PPM1LQ5SGD2 360 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GPRC6AQ5T6X5 926 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 XP32Q5T750 250 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM198Q66K66 360 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 OGFOD2Q6N063 350 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 KLC3Q6P597 504 aa5.6□□□□□ -1.51
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