RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.95□□□□□ -1.3
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RABGEF1-206ENST00000461017 GPR34Q9UPC5 381 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 IGF2RP11717 2491 aa6.95□□□□□ -1.3
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RABGEF1-206ENST00000461017 APC2O95996 2303 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CACNA1BQ00975 2339 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SPTBP11277 2137 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGEF1-206ENST00000461017 PCM1Q15154 2024 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.93□□□□□ -1.3
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-DPA1P20036 260 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 KELP23276 732 aa6.93□□□□□ -1.3
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RABGEF1-206ENST00000461017 HMGCLP35914 325 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CETN2P41208 172 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CTSCP53634 463 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1D5P58170 312 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 DCDC1P59894 354 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 E2F1Q01094 437 aa6.93□□□□□ -1.3
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