RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 AGPAT1Q99943 283 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ZWILCHQ9H900 591 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 LHX9Q9NQ69 397 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 SPAG6O75602 509 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 UBXN7O94888 489 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 MT-ND3P03897 115 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 AMD1P17707 334 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 EPHB1P54762 984 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PPP1R3BQ86XI6 285 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 RMI1Q9H9A7 625 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 MAP10Q9P2G4 905 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 A0A0J9YYE9 177 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 C21orf140B9A014 251 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 MAFKO60675 156 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 RNF8O76064 485 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 TRBC1P01850 177 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 FGF5P12034 268 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 MIPP30301 263 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 HCAR3P49019 387 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 MAMLD1Q13495 774 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 MARC1Q5VT66 337 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ACAD10Q6JQN1 1059 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PRR7Q8TB68 274 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 RUFY1Q96T51 708 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 UCK1Q9HA47 277 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 NT5MQ9NPB1 228 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ACSS2Q9NR19 701 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 LUZP4Q9P127 313 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 MED13Q9UHV7 2174 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 H3BRJ5 948 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 GRID2O43424 1007 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 FZD6O60353 706 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 CLDN1O95832 211 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ITKQ08881 620 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 THAP4Q8WY91 577 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 SEC14L1Q92503 715 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PARVAQ9NVD7 372 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ARGFXA6NJG6 315 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 TIAF1O95411 115 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 CLDN7O95471 211 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 VIPP01282 170 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 TPM2P07951 284 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 AMPD1P23109 780 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 CCL11P51671 97 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 CDH6P55285 790 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 RPS18P62269 152 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 UGT8Q16880 541 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 KLC4Q9NSK0 619 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ARL4AP40617 200 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 UBE2HP62256 183 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 KRT31Q15323 416 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 CACHD1Q5VU97 1274 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 FAM92BQ6ZTR7 304 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 NEK11Q8NG66 645 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 RSC1A1Q92681 617 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 ING2Q9H160 280 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 CARD9Q9H257 536 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 NUAK1O60285 661 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 LRCH4O75427 683 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRA-208ENST00000455631 CAPZBP47756 277 aa22.88■■□□□ 1.25
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