RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SNTNA6NMZ2 147 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 B8ZZF3 427 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NME4O00746 187 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NRP2O60462 931 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GDF11O95390 407 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NTRK1P04629 796 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C2P06681 752 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TGFBR1P36897 503 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEA6P43360 314 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GRB14Q14449 540 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 POU6F1Q14863 301 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPRE2Q15555 327 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MEP1AQ16819 746 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CDO1Q16878 200 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LIPMQ5VYY2 423 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM219BQ5XKK7 198 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 IFNEQ86WN2 208 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LEMD2Q8NC56 503 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TFAP2BQ92481 460 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PROX1Q92786 737 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PMEPA1Q969W9 287 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MYRFLQ96LU7 910 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TTPALQ9BTX7 342 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ANK1P16157 1881 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PQ72 361 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ISPDA4D126 451 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 AQP12BA6NM10 295 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SSX4O60224 188 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGB5P18084 799 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPN3P20807 821 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 YWHABP31946 246 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR2BP41595 481 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 BNIP2Q12982 314 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 XKR9Q5GH70 373 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 STEAP4Q687X5 459 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 AQP12AQ8IXF9 295 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPV3Q8NET8 790 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 BSNDQ8WZ55 320 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ELMO1Q92556 727 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MFSD3Q96ES6 412 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB16Q96NS5 453 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF157Q96PX1 679 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM15Q9C019 465 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TLR9Q9NR96 1032 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 COL20A1Q9P218 1284 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GABARAPO95166 117 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 AGXTP21549 392 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 IL12AP29459 219 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RRM2P31350 389 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RFC2P35250 354 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PTGS2P35354 604 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 OR3A3P47888 321 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LBX1P52954 281 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GJA9P57773 515 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 DGCR6Q14129 220 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 Q5BKY6 102 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SYTL1Q8IYJ3 562 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 KDM1BQ8NB78 822 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 URGCPQ8TCY9 931 aa8.35□□□□□ -1.07
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