RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 FREM2Q5SZK8 3169 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GTW7 788 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 BICDL2A1A5D9 508 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM92AA1XBS5 289 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D3BA6NDS4 549 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DIRC3C9JPN6 131 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 E7ENQ6 273 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MUSKO15146 869 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 THAP12O43422 761 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNG3O60359 315 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATG13O75143 517 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPN2O95208 641 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHEK2O96017 543 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 AFPP02771 609 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RETP07949 1114 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SETSIPP0DME0 302 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GABRG2P18507 467 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FDXRP22570 491 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC11A2P49281 568 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC8A3P57103 927 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2HP62256 183 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAD2Q05329 585 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 BIRC2Q13490 618 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELF2Q15723 593 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GEN1Q17RS7 908 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLK5Q496M5 336 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO43Q4G163 708 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RABL3Q5HYI8 236 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GDF7Q7Z4P5 450 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRLQ86TD4 932 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMPRSS6Q8IU80 811 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRYBG2Q8N1P7 616 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL17DQ8TAD2 202 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 WFDC5Q8TCV5 224 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF139Q8WU17 664 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SORCS1Q8WY21 1168 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM149B1Q96BN6 582 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNKPQ96T60 521 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CIPCQ9C0C6 399 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAI2Q9GZS0 605 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNPLA8Q9NP80 782 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ETAA1Q9NY74 926 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL37Q9NZH6 218 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 COX16Q9P0S2 106 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEC1Q9P2X7 70 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCNX2A6NKB5 2137 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LNP1A1A4G5 178 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEI4A8MW99 385 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM233B4DJY2 109 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 WASH3PC4AMC7 463 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASA4BC9J798 803 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRRT4C9JH25 899 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASA4O43374 803 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM20BO75063 409 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS4BO75351 444 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRAP2O75791 330 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLKB1P03952 638 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFIP05156 583 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRPP07492 148 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HLA-EP13747 358 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TGM1P22735 817 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRKCHP24723 683 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R2P41236 205 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTGER3P43115 390 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFAP3P55082 362 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 UCP3P55916 312 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAOAP59103 153 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms