RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417088.2

RPS28-201, Transcript of ribosomal protein S28, humanhuman

TSL 2

Gene RPS28, Length 334 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28-201ENST00000417088 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 CNTD1Q8N815 330 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 CCNYQ8ND76 341 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 EID2BQ96D98 161 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 HDAC11Q96DB2 347 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 CARD9Q9H257 536 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 CBX8Q9HC52 389 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 DTLQ9NZJ0 730 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 PTPN13Q12923 2485 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 A0A0G2JNG1 304 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 KCNK1O00180 336 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 NKX2-8O15522 239 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 GRID2O43424 1007 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 NUAK1O60285 661 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 KRT7P08729 469 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 F3P13726 295 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 SLC2A4P14672 509 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 MAPK9P45984 424 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 POLE2P56282 527 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 UBASH3AP57075 661 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 ZBTB17Q13105 803 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 KIR2DS5Q14953 304 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 LUZP1Q86V48 1076 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 RAPGEF5Q92565 580 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 IQCDQ96DY2 449 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 APMAPQ9HDC9 416 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 OR5K4A6NMS3 321 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 GYPCP04921 128 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 KDELR1P24390 212 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 CLCNKAP51800 687 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 KCNAB2Q13303 367 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 GALNT3Q14435 633 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 GPR26Q8NDV2 337 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 CATSPER2Q96P56 530 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 RNF157Q96PX1 679 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 ZPBPQ9BS86 351 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 OR2AG1Q9H205 316 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 KLHL3Q9UH77 587 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 LILRA5A6NI73 299 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 STK17BO94768 372 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 H2AFZP0C0S5 128 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 MAN1A1P33908 653 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 CCR10P46092 362 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 TPM4P67936 248 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 ALS2CLQ60I27 953 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 H2AFVQ71UI9 128 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 PLD5Q8N7P1 536 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 TRIB3Q96RU7 358 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 KLC4Q9NSK0 619 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS28-201ENST00000417088 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms