RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 STON1Q9Y6Q2 735 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 PTPRJQ12913 1337 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRK-210ENST00000415055 ZNF840PA6NDX5 716 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 FAM47DPA6NHR8 397 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 B5MCH6 92 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRK-210ENST00000415055 ATP2C2O75185 946 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRK-210ENST00000415055 GANCQ8TET4 914 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRK-210ENST00000415055 GTF3C6Q969F1 213 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRK-210ENST00000415055 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 TSPAN18Q96SJ8 248 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRK-210ENST00000415055 H0YCG3 227 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 COCHO43405 550 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 USP12O75317 370 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 FAM155BO75949 473 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRK-210ENST00000415055 ZNF202O95125 648 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 SEMA4FO95754 770 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 AGR2O95994 175 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 MT-CO3P00414 261 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRK-210ENST00000415055 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 SLC29A2Q14542 456 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 POSTNQ15063 836 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 INSCQ1MX18 579 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 CFAP221Q4G0U5 840 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 MDH1BQ5I0G3 518 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 HECTD3Q5T447 861 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 KRT79Q5XKE5 535 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 AFMIDQ63HM1 303 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 ADALQ6DHV7 355 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 FAAH2Q6GMR7 532 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-210ENST00000415055 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.69□□□□□ -1.66
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