RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.54□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DMTF1Q9Y222 760 aa9.54□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.54□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MATN3O15232 486 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC31A1O15431 190 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACSL4O60488 711 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDH16O75309 829 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LATS1O95835 1130 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DDAH2O95865 285 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 APRTP07741 180 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PHBP35232 272 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ETV5P41161 510 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAPKAPK2P49137 400 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 METAP1P53582 386 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NR0B2Q15466 257 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCTD11Q693B1 232 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FBXL22Q6P050 247 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC8BQ6P9F7 803 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYS1Q717R9 158 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DTX1Q86Y01 620 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPXM2Q8N436 756 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR13H1Q8NG92 308 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLK6Q92876 244 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM129BQ96TA1 746 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GBA3Q9H227 469 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VANGL2Q9ULK5 521 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.53□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 APCP25054 2843 aa9.52□□□□□ -0.88
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNK1O00180 336 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSMD3O43242 534 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AP2A1O95782 977 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TACR2P21452 398 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C5AR1P21730 350 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSMB4P28070 264 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GCAP28676 217 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP5DP30049 168 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD70P32970 193 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DRD3P35462 400 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ELK3P41970 407 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC11A2P49281 568 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAPK10P53779 464 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GYS2P54840 703 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RP1P56715 2156 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ST8SIA6P61647 398 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZBTB17Q13105 803 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BBS9Q3SYG4 887 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PARP15Q460N3 678 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MPPE1Q53F39 396 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAXCQ5TGI0 409 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAP1GAP2Q684P5 730 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCTD16Q68DU8 428 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PID1Q7Z2X4 250 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCNJLQ8IV13 435 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AHI1Q8N157 1196 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STK40Q8N2I9 435 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNTD1Q8N815 330 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TEX19Q8NA77 164 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NETO2Q8NC67 525 aa9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms