RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409402.8

SPIRE1-202, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPIRE1, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-202ENST00000409402 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.92■■□□□ 1.58
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SPIRE1-202ENST00000409402 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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SPIRE1-202ENST00000409402 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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SPIRE1-202ENST00000409402 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1-202ENST00000409402 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1-202ENST00000409402 SCAMP5Q8TAC9 235 aa24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1-202ENST00000409402 NXNL1Q96CM4 212 aa24.88■■□□□ 1.57
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