RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 NUAK1O60285 661 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ANXA9O76027 345 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 AGTP01019 485 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ACP5P13686 325 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMB4P28070 264 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 GLYATL1Q969I3 302 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 HES6Q96HZ4 224 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 FICDQ9BVA6 458 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 CARD9Q9H257 536 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM39Q9HCM9 518 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 LHX6Q9UPM6 363 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNK6Q9Y257 313 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 GRID2O43424 1007 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ALDH4A1P30038 563 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 INHBCP55103 352 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 B4GALNT1Q00973 533 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PRPSAP1Q14558 356 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 AMZ1Q400G9 498 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF438Q7Z4V0 828 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC13Q8NBP0 860 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATA13Q96N96 652 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.02■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP6O43182 974 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 B4GAT1O43505 415 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT86O43790 486 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 OR1D5P58170 312 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM74Q96NL1 305 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 APOL2Q9BQE5 337 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 STRADBQ9C0K7 418 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ASCL3Q9NQ33 180 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 IL17CQ9P0M4 197 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.01■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ZZEF1O43149 2961 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PPM1DO15297 605 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 MTX2O75431 263 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 EML2O95834 649 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CCKBRP32239 447 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SPAM1P38567 509 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 OLIG2Q13516 323 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 NR1D2Q14995 579 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP9Q49MG5 647 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CRTC3Q6UUV7 619 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC112Q8NEF3 446 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC37A2Q8TED4 501 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC46A1Q96NT5 459 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 RDH14Q9HBH5 336 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 IL26Q9NPH9 171 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 THSD1Q9NS62 852 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR89AB7ZAQ6 455 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ZW10O43264 779 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 SNX2O60749 519 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR89BP0CG08 455 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ITPKBP27987 946 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ADRA1AP35348 466 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCG1P45844 678 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ERVPABLB-1P60509 514 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC173Q0VFZ6 552 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 CHRNA6Q15825 494 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 IGF2-ASQ6U949 168 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM151BQ6UXP7 276 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 RANBP10Q6VN20 620 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB11FIP2Q7L804 512 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms