RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384105.1

RNU6V-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear variant sequence with SNRPE pseudogene sequence, humanhuman

BASIC

Gene RNU6V, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6V-201ENST00000384105 ABHD12Q8N2K0 398 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TMEM178AQ8NBL3 297 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SCCPDHQ8NBX0 429 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 C2CD4CQ8TF44 421 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CLEC4CQ8WTT0 213 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 WDR60Q8WVS4 1066 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SEPT1Q8WYJ6 367 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RND1Q92730 232 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SLCO2A1Q92959 643 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ERGIC1Q969X5 290 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IQCDQ96DY2 449 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RIPOR3Q96MK2 946 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 GUCD1Q96NT3 240 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 QRFPRQ96P65 431 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PSD2Q9BQI7 771 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 LZTS2Q9BRK4 669 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 HAUS8Q9BT25 410 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 KATNAL1Q9BW62 490 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 STK33Q9BYT3 514 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PITPNM3Q9BZ71 974 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TRIM4Q9C037 500 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PCDHAC1Q9H158 963 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CCDC134Q9H6E4 229 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 HELLSQ9NRZ9 838 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RNF186Q9NXI6 227 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CHPF2Q9P2E5 772 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MBD2Q9UBB5 411 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 UPB1Q9UBR1 384 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 GTF3C4Q9UKN8 822 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TNNQ9UQP3 1299 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 KLHL20Q9Y2M5 609 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 DTNAQ9Y4J8 743 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MEGF6O75095 1541 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 FLT1P17948 1338 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RGS12O14924 1447 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CECR2Q9BXF3 1484 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 FAM168BA1KXE4 195 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 NPIPB13A6NJU9 1138 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PLOD2O00469 737 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TO15178 435 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 NCAM2O15394 837 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 B4GALT2O60909 372 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 GLP2RO95838 553 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IGKV1-17P01599 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IGKV1D-16P01601 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IGHV4-59P01825 116 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ASNSP08243 561 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ARL14EPLP0DKL9 152 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MYBP10242 640 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CYP4B1P13584 511 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RPL17P18621 184 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ELK1P19419 428 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MSH3P20585 1137 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 KLRK1P26718 216 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ADSSP30520 456 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 HALP42357 657 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RGRP47804 291 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 LMAN1P49257 510 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RPS6KA3P51812 740 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 METAP1P53582 386 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RCAN1P53805 252 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CACNB3P54284 484 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 EVA1CP58658 441 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TAS2R38P59533 333 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 CDK18Q07002 472 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 EBI3Q14213 229 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ARHGEF6Q15052 776 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 E2F5Q15329 346 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 RPE65Q16518 533 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ME3Q16798 604 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 MOGAT2Q3SYC2 334 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TBRG1Q3YBR2 411 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6V-201ENST00000384105 DEFB121Q5J5C9 76 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms