RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 FCRL5Q96RD9 977 aa23.31■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 UBP1Q9NZI7 540 aa23.31■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 VPS18Q9P253 973 aa23.31■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa23.31■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 PPM1DO15297 605 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 NDST3O95803 873 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ALDH4A1P30038 563 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 CD68P34810 354 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 CXADRP78310 365 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 AMZ1Q400G9 498 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ALS2CLQ60I27 953 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 TMC3Q7Z5M5 1100 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 SLITRK4Q8IW52 837 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 GPR26Q8NDV2 337 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 DPH1Q9BZG8 443 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 SEMA6CQ9H3T2 930 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 RDH14Q9HBH5 336 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF711Q9Y462 761 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 H7C0C1 242 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 PMPCBO75439 489 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 EML2O95834 649 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 PYGMP11217 842 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ATP5OP48047 213 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 BIRC2Q13490 618 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 LRP8Q14114 963 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 MAP9Q49MG5 647 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 BROXQ5VW32 411 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 USP53Q70EK8 1073 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 PID1Q7Z2X4 250 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 GPR155Q7Z3F1 870 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ACTL9Q8TC94 416 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 HES6Q96HZ4 224 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 PISDQ9UG56 409 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 LOXL2Q9Y4K0 774 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 LOC400499M0QZD8 3231 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 CPNE6O95741 557 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 SLC4A1P02730 911 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 NFKB1P19838 968 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 CD1CP29017 333 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 GPR3P46089 330 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 MPP3Q13368 585 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 PHF19Q5T6S3 580 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 PIM3Q86V86 326 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF567Q8N184 647 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 NUDT22Q9BRQ3 303 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 SPATA16Q9BXB7 569 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 GPR63Q9BZJ6 419 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 TRABDQ9H4I3 376 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 CPNE5Q9HCH3 593 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 SPO11Q9Y5K1 396 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 BPTFQ12830 3046 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ANXA9O76027 345 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 JMJD7P0C870 316 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ITIH1P19827 911 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 SLC5A2P31639 672 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 TMPRSS3P57727 454 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 DCDC1P59894 354 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 KDELC1Q6UW63 502 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 JAMLQ86YT9 394 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 RMI1Q9H9A7 625 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ATXN10Q9UBB4 475 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 SSUH2Q9Y2M2 353 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-201ENST00000378543 ATRXP46100 2492 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 AURKAO14965 403 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 NUAK1O60285 661 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC175P0C221 793 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 RBP3P10745 1247 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 ACP5P13686 325 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 RBL1P28749 1068 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 ETV5P41161 510 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 UCNP55089 124 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 WNT3AP56704 352 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 CLN3Q13286 438 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 C16orf72Q14CZ0 275 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 NKAIN2Q5VXU1 208 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-201ENST00000378543 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms