RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ARAFP10398 606 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PTPN2P17706 415 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DPP6P42658 865 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ACADSBP45954 432 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 BMXP51813 675 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NEK2P51955 445 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NAGLUP54802 743 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GABARAPL2P60520 117 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GBE1Q04446 702 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TNK2Q07912 1038 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PRPSAP1Q14558 356 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 POU4F3Q15319 338 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6AP1Q15904 470 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KCNA10Q16322 511 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GPR107Q5VW38 600 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CXCL17Q6UXB2 119 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SPRED1Q7Z699 444 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KCNMB4Q86W47 210 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A9Q8IVM8 553 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 BEST2Q8NFU1 509 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ACDQ96AP0 544 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TAMM41Q96BW9 452 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NPAS2Q99743 824 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 BDH2Q9BUT1 245 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D13Q9NVG8 400 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SMOXQ9NWM0 555 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SYBUQ9NX95 663 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PSAT1Q9Y617 370 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PPW3 197 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 E7ENX8 843 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SDHDO14521 159 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PFDN6O15212 129 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CSPG5O95196 566 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 LRPAP1P30533 357 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CSRP3P50461 194 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CCR3P51677 355 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GALNT2Q10471 571 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ATP1A4Q13733 1029 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 OXA1LQ15070 435 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PCSK7Q16549 785 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CMC1Q7Z7K0 106 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM192Q8IY95 271 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CBR4Q8N4T8 237 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RNF148Q8N7C7 305 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TRPV3Q8NET8 790 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 STARD8Q92502 1023 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MYRFLQ96LU7 910 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLC29A1Q99808 456 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RMND5AQ9H871 391 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRHQ9HD43 1115 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CASS4Q9NQ75 786 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.17□□□□□ -1.26
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