RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 PROX1Q92786 737 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 NSMCE2Q96MF7 247 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SNTG2Q9NY99 539 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 YDJCA8MPS7 323 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 XPNPEP2O43895 674 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 RAP2AP10114 183 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PCNAP12004 261 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 MTHFRP42898 656 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 POU4F1Q01851 419 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 COLEC12Q5KU26 742 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 OPTCQ9UBM4 332 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa21.62■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SYCE1LA8MT33 242 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 H3BMM5 538 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 DCLK1O15075 740 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 NOBOXO60393 691 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SUPT7LO94864 414 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 MAGP20916 626 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 OR4D2P58180 307 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZNF691Q5VV52 312 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 GLYATQ6IB77 296 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SULT1C3Q6IMI6 304 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 FBLIM1Q8WUP2 373 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 MMP27Q9H306 513 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 USE1Q9NZ43 259 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 MAU2Q9Y6X3 613 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CCDC154A6NI56 674 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CCRL2O00421 344 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 B4GALT5O43286 388 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 NFKB1P19838 968 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 IL12AP29459 219 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 TGFBR1P36897 503 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SLC1A2P43004 574 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 MAP2K4P45985 399 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SNX16P57768 344 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SH3BP2P78314 561 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZNF678Q5SXM1 525 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 MCOLN3Q8TDD5 553 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SLAMF8Q9P0V8 285 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 FYNP06241 537 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 RBP1P09455 135 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 UBL4AP11441 157 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 HTR3AP46098 478 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SLC12A2P55011 1212 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 C19orf57Q0VDD7 668 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CDK5R2Q13319 367 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 DGKZQ13574 1117 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CLCA4Q14CN2 919 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 BRMS1LQ5PSV4 323 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD34AQ69YU3 496 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 FAM151AQ8WW52 585 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 L3HYPDHQ96EM0 354 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CDT1Q9H211 546 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 UBP1Q9NZI7 540 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ERVK-18Q9QC07 812 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 DSEQ9UL01 958 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PIP5K1BO14986 540 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CPB1P15086 417 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 RYKP34925 604 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CCDC81Q6ZN84 652 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SLC38A6Q8IZM9 456 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 HS3ST5Q8IZT8 346 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PIF1Q9H611 641 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 RNF146Q9NTX7 359 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 EXD2Q9NVH0 621 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 BTAF1O14981 1849 aa21.6■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SNX2O60749 519 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 RCAN2Q14206 197 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 RPS6KA2Q15349 733 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZNF404Q494X3 552 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 UNC50Q53HI1 259 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SPATC1Q76KD6 591 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ACOT1Q86TX2 421 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PLD3Q8IV08 490 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 TMEM246Q9BRR3 403 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 GPR45Q9Y5Y3 372 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms