RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH3GL2Q99962 352 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 RHNO1Q9BSD3 238 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMAN2LQ9H0V9 348 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PANK3Q9H999 370 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF186Q9NXI6 227 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 OBP2AQ9NY56 170 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERAP1Q9NZ08 941 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTSZQ9UBR2 303 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MUTYHQ9UIF7 546 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNNQ9UQP3 1299 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CARD8Q9Y2G2 431 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP83Q9Y592 693 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 HCFC1P51610 2035 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0G2JNG1 304 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR5K3A6NET4 321 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACOD1A6NK06 481 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM220BPB1ANY3 271 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 H0Y9J4 135 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 H0YIN7 160 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF197O14709 1029 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 IDH3BO43837 385 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 FTCDO95954 541 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHRM4P08173 479 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGA2BP08514 1039 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC2A4P14672 509 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GP9P14770 177 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF19P17023 458 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX5P17844 614 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL4RP24394 825 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPHA2P29317 976 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 FASLGP48023 281 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSCP56915 257 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 AP2B1P63010 937 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRIK3Q13003 919 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACVR2BQ13705 512 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPARCL1Q14515 664 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIR2DS5Q14953 304 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 P2RY6Q15077 328 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 EDRF1Q3B7T1 1238 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIPR1Q53HC9 387 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 IZUMO3Q5VZ72 239 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GGNBP1Q5YKI7 109 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 FRG2Q64ET8 278 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIN54Q6MZP7 749 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 C17orf99Q6UX52 265 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 RRAGAQ7L523 313 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYT13Q7L8C5 426 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC16A9Q7RTY1 509 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 LONP2Q86WA8 852 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 NRROSQ86YC3 692 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP7D3Q8IWC1 876 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIAA2013Q8IYS2 634 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPD1LQ8N335 351 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q8NBF4 154 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUMF1Q8NBK3 374 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM178AQ8NBL3 297 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2T11Q8NH01 316 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 THAP6Q8TBB0 222 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM71BQ8TC56 605 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB40AQ8WXH6 277 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHF21AQ96BD5 680 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 C3orf49Q96BT1 292 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ORAI1Q96D31 301 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 EID2BQ96D98 161 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MASTLQ96GX5 879 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPATCH3Q96I76 525 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIN3AQ96ST3 1273 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYD88Q99836 296 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLEC7AQ9BXN2 247 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRINP2Q9C0B6 783 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TKTL2Q9H0I9 626 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 P2RY12Q9H244 342 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNB4Q9HAV0 340 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 VEZTQ9HBM0 779 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGEE1Q9HCI5 957 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRPC7Q9HCX4 862 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR108Q9NPR9 543 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNFRSF19Q9NS68 423 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC38A7Q9NVC3 462 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAB2Q9NYJ8 693 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms