RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 CD86P42081 329 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 CLCQ05315 142 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 FXNQ16595 210 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 RIMKLAQ8IXN7 391 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 CLEC4FQ8N1N0 589 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ZFP42Q96MM3 310 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 NTN4Q9HB63 628 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 CACNG4Q9UBN1 327 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 CDH9Q9ULB4 789 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TRIM17Q9Y577 477 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 C16orf96A6NNT2 1141 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 IRAK2O43187 625 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 KPNA6O60684 536 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TULP3O75386 442 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 C1RP00736 705 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 PRR35P0CG20 571 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 SLC2A3P11169 496 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ITKQ08881 620 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 AFMIDQ63HM1 303 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TAMM41Q96BW9 452 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ATOH8Q96SQ7 321 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TRIM62Q9BVG3 475 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 LRRC3Q9BY71 257 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 PIF1Q9H611 641 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 OSER1Q9NX31 292 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 SLAMF8Q9P0V8 285 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 SUN2Q9UH99 717 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 USP22Q9UPT9 525 aa18.23■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 CES1P23141 567 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 UFM1P61960 85 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF792Q3KQV3 632 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TIGD2Q4W5G0 525 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 SPARTQ8N0X7 666 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TMBIM1Q969X1 311 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 MAGEE1Q9HCI5 957 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 NT5MQ9NPB1 228 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ATAD3AQ9NVI7 634 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ANKRD12Q6UB98 2062 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 A0A1B0GTL3 188 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 CLDN25C9JDP6 229 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 CCR1P32246 355 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 OPRL1P41146 370 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TMED10P49755 219 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 OR4D2P58180 307 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 OCA2Q04671 838 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 EMX2Q04743 252 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF846Q147U1 533 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 GLYATQ6IB77 296 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 FRA10AC1Q70Z53 315 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 STK32CQ86UX6 486 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 BRINP2Q9C0B6 783 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 POPDC3Q9HBV1 291 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 DAPK2Q9UIK4 370 aa18.22■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 UPK1AO00322 258 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 PRSS23O95084 383 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 NPPAP01160 153 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 RENBPP51606 427 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 MAXP61244 160 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 ECT2LQ008S8 904 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 DNAJB3Q8WWF6 145 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 KATNBL1Q9H079 304 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 MPP6Q9NZW5 540 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TIMM22Q9Y584 194 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 CPQQ9Y646 472 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 KRBA1A5PL33 1030 aa18.21■□□□□ 0.51
LRRC25-201ENST00000339007 TMEM247A6NEH6 219 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms