RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326039.3

GRTP1-201, Transcript of growth hormone regulated TBC protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GRTP1, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1-201ENST00000326039 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.36■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.36■□□□□ 0.85
GRTP1-201ENST00000326039 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.36■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.35■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 OR2AG1Q9H205 316 aa20.35■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.34■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 LDB2O43679 373 aa20.34■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 ACTN2P35609 894 aa20.34■□□□□ 0.85
GRTP1-201ENST00000326039 SEMA5AQ13591 1074 aa20.34■□□□□ 0.85
GRTP1-201ENST00000326039 LRP8Q14114 963 aa20.34■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.34■□□□□ 0.85
GRTP1-201ENST00000326039 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GRTP1-201ENST00000326039 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.34■□□□□ 0.85
GRTP1-201ENST00000326039 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GRTP1-201ENST00000326039 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.33■□□□□ 0.85
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF398Q8TD17 642 aa20.33■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 SNX12Q9UMY4 172 aa20.33■□□□□ 0.85
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GRTP1-201ENST00000326039 MT-CO3P00414 261 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 GPR89BP0CG08 455 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 ACTR1BP42025 376 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 GRIA1P42261 906 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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GRTP1-201ENST00000326039 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 CAMK2BQ13554 666 aa20.32■□□□□ 0.84
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GRTP1-201ENST00000326039 C4orf22Q6V702 233 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 MAPK15Q8TD08 544 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 ABCG4Q9H172 646 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.32■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 B4DGG1 531 aa20.31■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 CES2O00748 559 aa20.31■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 GPR39O43194 453 aa20.31■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 CDK14O94921 469 aa20.31■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
GRTP1-201ENST00000326039 PEX6Q13608 980 aa20.31■□□□□ 0.84
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