RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 CCR10P46092 362 aa15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 ASPHQ12797 758 aa15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 IL17RCQ8NAC3 791 aa15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 OR7D4Q8NG98 312 aa15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 OR6P1Q8NGX9 317 aa15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 HDAC10Q969S8 669 aa15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 VPS28Q9UK41 221 aa15.78■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 LDB2O43679 373 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 GJB3O75712 270 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 TFEBP19484 476 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 HK2P52789 917 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 PRKAA1Q13131 559 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF235Q14590 738 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 CHPFQ8IZ52 775 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 POU5F2Q8N7G0 328 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 CFAP61Q8NHU2 1237 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 UCMAQ8WVF2 138 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 CMTM5Q96DZ9 223 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 IFT43Q96FT9 208 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF599Q96NL3 588 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 NDNQ99608 321 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 SPON2Q9BUD6 331 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 MAGEH1Q9H213 219 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 PDFQ9HBH1 243 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 KCTD3Q9Y597 815 aa15.77■□□□□ 0.12
TSNARE1-201ENST00000307180 WDFY4Q6ZS81 3184 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 MUSKO15146 869 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 HDAC3O15379 428 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 EPOP01588 193 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 RPSAP08865 295 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 ARSDP51689 593 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF234Q14588 700 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 GALNT7Q86SF2 657 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 ULK2Q8IYT8 1036 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 LSMEM2Q8N112 164 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 ALG14Q96F25 216 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 TSPAN17Q96FV3 270 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 FEM1CQ96JP0 617 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 OLFM1Q99784 485 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 RETREG1Q9H6L5 497 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 VWA7Q9Y334 891 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 E9PBE3 544 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 CCL22O00626 93 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 GRID2O43424 1007 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHL41O60662 606 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 PSMG1O95456 288 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 S1PR4O95977 384 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 GLDCP23378 1020 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 GCKP35557 465 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 COPAP53621 1224 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 PRAMEP78395 509 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 GNA12Q03113 381 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 LAMB3Q13751 1172 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM83EQ2M2I3 478 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 IL31Q6EBC2 164 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 CCNYL1Q8N7R7 359 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF366Q8N895 744 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 CLPTM1LQ96KA5 538 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 OR52B2Q96RD2 323 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 VTI1BQ9UEU0 232 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 OR51B4Q9Y5P0 310 aa15.76■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 ILVBLA1L0T0 632 aa15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 F8W8V4 182 aa15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 SLCO1B7G3V0H7 640 aa15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBTB14O43829 449 aa15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 SNAP91O60641 907 aa15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 ADAM23O75077 832 aa15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 CIB2O75838 187 aa15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 KRT36O76013 467 aa15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 HLA-DPA1P20036 260 aa15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 IL12RB1P42701 662 aa15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 STK19P49842 368 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TSNARE1-201ENST00000307180 OXCT1P55809 520 aa15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms