RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEP78395 509 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 NFATC2Q13469 925 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 HIF1AQ16665 826 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ALG11Q2TAA5 492 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 UAP1L1Q3KQV9 507 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 BBS9Q3SYG4 887 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 KCTD16Q68DU8 428 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PDIK1LQ8N165 341 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PEX13Q92968 403 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 TM7SF3Q9NS93 570 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CRLS1Q9UJA2 301 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ESYT3A0FGR9 886 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 PRSS38A1L453 326 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 OR51F1A6NGY5 319 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 MTX2O75431 263 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 BANF1O75531 89 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 RASGRP1O95267 797 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 PSMA3P25788 255 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 CA5AP35218 305 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 RXRGP48443 463 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 GUCY2DQ02846 1103 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SHBQ15464 509 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TRADDQ15628 312 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 MSS51Q4VC12 460 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SNX20Q7Z614 316 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 RBFAQ8N0V3 343 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 MFSD3Q96ES6 412 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TREX1Q9NSU2 369 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEB16A2A368 324 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 H3BM21 787 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TNFRSF10CO14798 259 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 BLKP51451 505 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 HK3P52790 923 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 PLTPP55058 493 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ARL4CP56559 192 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ACVR1Q04771 509 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 BNIP3Q12983 259 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 STPG1Q5TH74 334 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 OR2AG1Q9H205 316 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM39Q9HCM9 518 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SMOXQ9NWM0 555 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 YKT6O15498 198 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TNFP01375 233 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 PRSS56P0CW18 603 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 CACNG1Q06432 222 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TCEA2Q15560 299 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 GPRC6AQ5T6X5 926 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ARMC3Q5W041 872 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 AFTPHQ6ULP2 937 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 GATAD2AQ86YP4 633 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 VPS18Q9P253 973 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ATXN10Q9UBB4 475 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SUFUQ9UMX1 484 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 PIAS2O75928 621 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 FUCA1P04066 466 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 CTSEP14091 401 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 AKT1P31749 480 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 GNPDA1P46926 289 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 GPR33Q49SQ1 333 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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