RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHB1P54762 984 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 STX17P56962 302 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CHAF1BQ13112 559 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 KYNUQ16719 465 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF3Q5VWG9 929 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 NAA35Q5VZE5 725 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CPZQ66K79 652 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM26Q6ZUK4 368 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZVL8 140 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 KMT5CQ86Y97 462 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC185Q8N715 623 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC1AQ8NC01 280 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PDFQ9HBH1 243 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 POT1Q9NUX5 634 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.77□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 J3KR12 359 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 DFFAO00273 331 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX12O00623 359 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRTM2O43300 516 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 GRID2O43424 1007 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CALB1P05937 261 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ACP5P13686 325 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TYRP1P17643 537 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 GM2AP17900 193 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 VCLP18206 1134 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 HALP42357 657 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PTGIRP43119 386 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPZBP47756 277 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 GLRBP48167 497 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CLCNKAP51800 687 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 GFERP55789 205 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 HDAC4P56524 1084 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 NOMO3P69849 1222 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3BP2P78314 561 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ARTNQ5T4W7 220 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ISM2Q6H9L7 571 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 IRGCQ6NXR0 463 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 MTFR2Q6P444 385 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8NA96 180 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 GPT2Q8TD30 523 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TEKT4Q8WW24 435 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CPT1BQ92523 772 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 AGAP3Q96P47 875 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CD180Q99467 661 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB33BQ9H082 229 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 KLC2Q9H0B6 622 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CARD9Q9H257 536 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC19Q9H756 370 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 COPG2Q9UBF2 871 aa7.76□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.76□□□□□ -1.17
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