RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 SUSD3Q96L08 255 aa25.1■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM74Q96NL1 305 aa25.1■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 SEPHS2Q99611 448 aa25.1■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM248Q9NWD8 314 aa25.1■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF711Q9Y462 761 aa25.1■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 CNTN5O94779 1100 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 CES1P23141 567 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 CASP2P42575 452 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 RCAN2Q14206 197 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 ALFQ53S48 1182 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 FBXO48Q5FWF7 155 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 MRNIPQ6NTE8 343 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 TEX26Q8N6G2 289 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 ARRDC2Q8TBH0 407 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 TADA1Q96BN2 335 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 POPDC3Q9HBV1 291 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 USP22Q9UPT9 525 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 ARL5AQ9Y689 179 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 V9GYQ6 96 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 TTC3P53804 2025 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC162PA2VCL2 907 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 OR4Q2P0C623 313 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 HLCSP50747 726 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 MGAT3Q09327 533 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 MS4A13Q5J8X5 152 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 OGFOD2Q6N063 350 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 TBPL2Q6SJ96 375 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 FBXO39Q8N4B4 442 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 BIRC7Q96CA5 298 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 AIG1Q9NVV5 245 aa25.09■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 EEDO75530 441 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 CD52P31358 61 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 UFM1P61960 85 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 ACVR1Q04771 509 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 KIAA2013Q8IYS2 634 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 PGBD5Q8N414 524 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 GPR150Q8NGU9 434 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.613e-7■■□□□ 13.4
CTBP1-201ENST00000290921 SLAMF8Q9P0V8 285 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF639Q9UID6 485 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 PADI3Q9ULW8 664 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 SH3GLB1Q9Y371 365 aa25.08■■□□□ 1.61
CTBP1-201ENST00000290921 DYTNA2CJ06 578 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 TRIM64BA6NI03 449 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC154A6NI56 674 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 CBFA2T3O75081 653 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 C21orf59P57076 290 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 BNIP3Q12983 259 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 MSANTD2Q6P1R3 559 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 OSCP1Q8WVF1 389 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 PIF1Q9H611 641 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 RNF112Q9ULX5 631 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 KERAO60938 352 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 INHBBP09529 407 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 PRR35P0CG20 571 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 TYMPP19971 482 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 TBX4P57082 545 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 STAG3L4Q8TBR4 150 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 PLEKHA8Q96JA3 519 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 TUBA1CQ9BQE3 449 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 NOL3O60936 208 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 GJB3O75712 270 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 SLC22A3O75751 556 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 PAX3P23760 479 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 SLC39A12Q504Y0 691 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 ANKS6Q68DC2 871 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 NANOGP8Q6NSW7 305 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 SERINC5Q86VE9 423 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 MON1AQ86VX9 555 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM199Q8N511 208 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 OR13C4Q8NGS5 318 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 KIAA1191Q96A73 305 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 COX4I2Q96KJ9 171 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 RNF145Q96MT1 663 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 CHID1Q9BWS9 393 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 NANOGQ9H9S0 305 aa25.06■■□□□ 1.6
CTBP1-201ENST00000290921 CATSPERZQ9NTU4 200 aa25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms