RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SCML2Q9UQR0 700 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SNAP29O95721 258 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 FDXRP22570 491 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 OR1D2P34982 312 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RANBP1P43487 201 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PTGR1Q14914 329 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 GTDC1Q4AE62 458 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 LZTR1Q8N653 840 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
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GINS1-201ENST00000262460 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 HGH1Q9BTY7 390 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 OLAHQ9NV23 265 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CD300AQ9UGN4 299 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PATJQ8NI35 1801 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 VWA8A3KMH1 1905 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 H0Y626 953 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ARPC2O15144 300 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PSMD3O43242 534 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ZNF623O75123 536 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TRIM16O95361 564 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 GSNP06396 782 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SERPINF2P08697 491 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 STC1P52823 247 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 LAMB3Q13751 1172 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.61□□□□□ -1.03
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GINS1-201ENST00000262460 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 HIC2Q96JB3 615 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RNF145Q96MT1 663 aa8.61□□□□□ -1.03
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GINS1-201ENST00000262460 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 U3KQV3 271 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 F5H5T6 163 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 DLGAP1O14490 977 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SEPT4O43236 478 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SLC7A4O43246 635 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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GINS1-201ENST00000262460 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 HSPA7P48741 367 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 DNAJB13P59910 316 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 GNA12Q03113 381 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PLD1Q13393 1074 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 LSAMPQ13449 338 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 NEDD8Q15843 81 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD46Q86W74 232 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 NLRC5Q86WI3 1866 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MFN1Q8IWA4 741 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.6□□□□□ -1.03
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GINS1-201ENST00000262460 LRRC58Q96CX6 371 aa8.6□□□□□ -1.03
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GINS1-201ENST00000262460 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 DHRS12A0PJE2 317 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PRAMEF11O60813 436 aa8.6□□□□□ -1.03
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