RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.21■□□□□ 0.19
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SPCS1-201ENST00000233025 CPNE7Q9UBL6 633 aa16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.21■□□□□ 0.19
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SPCS1-201ENST00000233025 A0A0G2JNG1 304 aa16.2■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 F5H423 210 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 KIR2DS3K7RE56 304 aa16.2■□□□□ 0.18
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SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP10-9P60411 292 aa16.2■□□□□ 0.18
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SPCS1-201ENST00000233025 RASSF9O75901 435 aa16.19■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 STSP08842 583 aa16.19■□□□□ 0.18
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SPCS1-201ENST00000233025 TYRP1P17643 537 aa16.19■□□□□ 0.18
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SPCS1-201ENST00000233025 GPR1P46091 355 aa16.18■□□□□ 0.18
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SPCS1-201ENST00000233025 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 C2CD6Q53TS8 623 aa16.18■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.18■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 FAM69BQ5VUD6 431 aa16.18■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.18■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa16.18■□□□□ 0.18
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SPCS1-201ENST00000233025 AVL9Q8NBF6 648 aa16.18■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 NDST4Q9H3R1 872 aa16.18■□□□□ 0.18
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SPCS1-201ENST00000233025 KCNK6Q9Y257 313 aa16.18■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.18■□□□□ 0.18
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SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GUH1 482 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 EDN3P14138 238 aa16.17■□□□□ 0.18
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SPCS1-201ENST00000233025 GPS2Q13227 327 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ATP1A4Q13733 1029 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF235Q14590 738 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ANO6Q4KMQ2 910 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 VWA3BQ502W6 1294 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 LZTR1Q8N653 840 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.17■□□□□ 0.18
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