RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RhocQ62159 193 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dennd2cQ6P9P8 914 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr366Q7TRY4 309 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp6cQ9CQR6 305 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itgb1bp2Q9R000 350 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nme4Q9WV84 186 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TriobpQ99KW3 2014 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Erich1E9PY43 332 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21738J3QP72 227 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Svs4P18419 113 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 E2f2P56931 443 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc22a23Q3UHH2 689 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zpbp2Q6X786 326 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ahcyl1Q80SW1 530 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tusc3Q8BTV1 347 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdcd2lQ8C5N5 364 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr345Q8VGK4 311 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc39a5Q9D856 535 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prokr1Q9JKL1 393 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Insl5Q9WUG6 135 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem45a2B7ZWJ5 289 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2610028H24RikG5E8K1 270 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hsd11b2P51661 386 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vtcn1Q7TSP5 283 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Samd4bQ80XS6 687 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf38Q8BI21 518 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim35Q8C006 501 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nox1Q8CIZ9 591 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc47a1Q8K0H1 567 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MpstQ99J99 297 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cmtm7Q9ESD6 167 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trpc4apQ9JLV2 797 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PikfyveQ9Z1T6 2097 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gp5O08742 567 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Coro1aO89053 461 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rps17P63276 135 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Xkr5Q5GH66 676 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc35e2Q8C811 405 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ints10Q8K2A7 710 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Efhc2Q9D485 750 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clic3Q9D7P7 237 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chek2Q9Z265 546 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cacna1cQ01815 2139 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv17-121A0A0G2JFA8 117 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Erich2E9Q1A6 463 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aif1O70200 147 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 WapP01173 134 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01631 113 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pnrc1Q3TWH3 297 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Upf3aQ3ULJ3 422 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tex24Q5DP50 351 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 VwdeQ6DFV8 926 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ChfrQ810L3 664 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lin52Q8CD94 116 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trpv3Q8K424 791 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MfrpQ8K480 584 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc44a3Q921V7 656 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnot11Q9CWN7 505 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf146Q9CZW6 359 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pinx1Q9CZX5 332 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TheglQ9DA15 459 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CenpkQ9ESN5 271 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krt6bQ9Z331 562 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mcf2A2AEU1 1111 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Btnl4A2CG29 586 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sp1O89090 784 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Epb41P48193 858 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc3P59034 257 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CkbQ04447 381 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TsnQ62348 228 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr213Q7TS32 327 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmcc2Q80W04 706 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kirrel1Q80W68 789 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr273Q8VG87 317 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdkal1Q91WE6 578 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf31Q924T7 1066 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cmc1Q9CPZ8 106 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PgcQ9D7R7 392 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bpifa3Q9D9J8 232 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C1qtnf3Q9ES30 246 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tbk1Q9WUN2 729 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bscl2Q9Z2E9 383 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DnpepQ9Z2W0 473 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tp53bp1P70399 1969 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FgaE9PV24 789 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm7971J3QMM8 481 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Csf3rP40223 837 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hsd17b4P51660 735 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Naa20P61600 178 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr798Q7TRH8 311 aa20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SvopQ8BFT9 548 aa20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.7 ms