RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ap2m1P84091 435 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam98aQ3TJZ6 515 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxk2Q3UCQ1 651 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctsll3Q3ULP7 331 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itga1Q3V3R4 1179 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtprrQ62132 656 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fez2Q6TYB5 348 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp2c1Q80XR2 918 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem198Q8BG75 360 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr48Q8BH57 676 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rmdn2Q8BSE0 410 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep68Q8C0D9 733 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TwnkQ8CIW5 685 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Agpat4Q8K4X7 378 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Imp4Q8VHZ7 291 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Camk1gQ91VB2 477 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FdpsQ920E5 353 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nrif1Q923B3 828 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf112Q96DY5 654 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp773Q9CZ29 471 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dusp12Q9D0T2 339 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam217aQ9D9W6 419 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spag4Q9JJF2 443 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SufuQ9Z0P7 484 aa11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TrrapQ80YV3 2565 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actl10A2AKE7 346 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itpripl1A2ASA8 547 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Galnt9G3X942 604 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhox2gL7MUB9 191 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r13L7N1X2 831 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ube3aO08759 870 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 XlrP05531 208 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctnna1P26231 906 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lim2P56563 173 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mc1rQ01727 315 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cul4aQ3TCH7 759 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q3U6N9 222 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxd4Q60688 444 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp2r5eQ61151 467 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EsrrbQ61539 433 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sdr16c5Q7TQA3 309 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ric8bQ80XE1 520 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NapepldQ8BH82 396 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc40Q8BI79 1192 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mageb18Q8BQR7 327 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RydenQ8CAK3 290 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrp11Q8CB67 483 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr18Q8K1Z6 331 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HpdlQ8K248 371 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Casc3Q8K3W3 698 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OafQ8QZR4 282 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cys1Q8R4T1 145 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Map3k21Q8VDG6 1002 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CenpqQ9CPQ5 267 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bzw1Q9CQC6 419 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bbs2Q9CWF6 721 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hhipl2Q9D2G9 717 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Llcfc1Q9D9P8 108 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IgtpQ9DCE9 423 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tssc4Q9JHE7 317 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc13a1Q9JHI4 594 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AicdaQ9WVE0 198 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn3Q9Z0G9 219 aa11.08□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Shank1D3YZU1 2167 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btbd18A0A0A6YY25 723 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttll11A4Q9F4 727 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pnldc1B2RXZ1 531 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp229E9PWT2 705 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6576F6YTZ4 274 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Man2b2O54782 1018 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B3galt1O54904 326 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chrna4O70174 629 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IkbkgO88522 412 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klk1b9P15949 261 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CryabP23927 175 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ElnP54320 860 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Msx3P70354 204 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adcy8P97490 1249 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdk18Q04899 451 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FcrlbQ5DRQ8 427 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CcncQ62447 283 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tfdp2Q64163 446 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ano6Q6P9J9 911 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd9Q8BH83 326 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Npsr1Q8BZP8 371 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cfap36Q8C6E0 343 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dennd1cQ8CFK6 786 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mkl1Q8K4J6 964 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr347Q8VGK2 312 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BniplQ99JU7 328 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plpp3Q99JY8 312 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp2u1Q9CX98 530 aa11.07□□□□□ -0.64
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Creb3l4Q9D2A5 370 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.8 ms