RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 LRRC45Q96CN5 670 aa22.21■■□□□ 1.15
SYT6-210ENST00000641643 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SYT6-210ENST00000641643 CCDC3Q9BQI4 270 aa22.21■■□□□ 1.15
SYT6-210ENST00000641643 VPS18Q9P253 973 aa22.21■■□□□ 1.15
SYT6-210ENST00000641643 AURKAO14965 403 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 AK4P27144 223 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 PSMB4P28070 264 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 HMGCLP35914 325 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 ADCY8P40145 1251 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 CTBSQ01459 385 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 OGFOD3Q6PK18 319 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 GPR156Q8NFN8 814 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 MDM1Q8TC05 714 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 NXPE2Q96DL1 559 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 FICDQ9BVA6 458 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 BPIFA1Q9NP55 256 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 TAAR2Q9P1P5 351 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 BPIP17213 487 aa22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 ACTR1BP42025 376 aa22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 ACTR1AP61163 376 aa22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 PYCR3Q53H96 274 aa22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 CDCP2Q5VXM1 449 aa22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 AK5Q9Y6K8 562 aa22.19■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 C5orf60A6NFR6 353 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 AGTP01019 485 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 GLB1P16278 677 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 CYP4F3Q08477 520 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 BIRC2Q13490 618 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 LRP8Q14114 963 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 C14orf28Q4W4Y0 310 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 NRROSQ86YC3 692 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 CCDC74AQ96AQ1 378 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 RMI1Q9H9A7 625 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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SYT6-210ENST00000641643 TCEA3O75764 348 aa22.17■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 SPIDRQ14159 915 aa22.17■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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SYT6-210ENST00000641643 NRSN2Q9GZP1 204 aa22.17■■□□□ 1.14
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SYT6-210ENST00000641643 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.16■■□□□ 1.14
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SYT6-210ENST00000641643 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 GLYATL1Q969I3 302 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 CARD9Q9H257 536 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 TRIM39Q9HCM9 518 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 DNAJC6O75061 913 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 PROSER1Q86XN7 944 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 APOL2Q9BQE5 337 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 DKK4Q9UBT3 224 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 MYLKQ15746 1914 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 C2orf81A6NN90 581 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 STX7O15400 261 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 GRID2O43424 1007 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 NUAK1O60285 661 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 PPFIA2O75334 1257 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 PNLIPP16233 465 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 SPAM1P38567 509 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 PARP6Q2NL67 630 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 P3H1Q32P28 736 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 RANBP10Q6VN20 620 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 SFTPA2Q8IWL1 248 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT6-210ENST00000641643 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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