RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	MAML1	Q92585	1016 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	KCNK6	Q9Y257	313 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A087X0T9	212 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A0G2JNG1	304 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599		B4E171	279 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SOD1	P00441	154 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	HLA-DQB2	P05538	268 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM228B	P0C875	321 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CSF2RB	P32927	897 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	UGT1A3	P35503	534 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	TSPAN7	P41732	249 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CD86	P42081	329 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CCR10	P46092	362 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CSRP3	P50461	194 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SQSTM1	Q13501	440 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	KIR2DS5	Q14953	304 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	H2AFV	Q71UI9	128 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SFRP1	Q8N474	314 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	NKD1	Q969G9	470 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CATSPER2	Q96P56	530 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	AGAP2	Q99490	1192 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ZPBP	Q9BS86	351 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	RAD18	Q9NS91	495 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	KLHL3	Q9UH77	587 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	OR5K4	A6NMS3	321 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	GRID2	O43424	1007 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	PROSC	O94903	275 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	LIF	P15018	202 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SPINT3	P49223	89 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	EPHA4	P54764	986 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	NFKB2	Q00653	900 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	INSC	Q1MX18	579 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ALS2CL	Q60I27	953 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKS6	Q68DC2	871 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	FATE1	Q969F0	183 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	COX14	Q96I36	57 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	TSGA13	Q96PP4	275 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SMIM14	Q96QK8	99 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	STARD5	Q9NSY2	213 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	14.55	□□□□□ -0.08	1e-6	■□□□□ 9.2
TARDBP-231	ENST00000639599	BPTF	Q12830	3046 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	LRP4	O75096	1905 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRD1	A4D1F6	860 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	DNAJC6	O75061	913 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	JCHAIN	P01591	159 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	TPM1	P09493	284 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	MC1R	Q01726	317 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	GBE1	Q04446	702 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	AP1B1	Q10567	949 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	LUZP1	Q86V48	1076 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	PMEPA1	Q969W9	287 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	HDAC11	Q96DB2	347 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	LYSMD1	Q96S90	227 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CTRC	Q99895	268 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CARD9	Q9H257	536 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CBX8	Q9HC52	389 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		14.54	□□□□□ -0.08

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