RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628742.2

SOX9-AS1-218, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 733 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.7□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 PRKAR1AP10644 381 aa6.69□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF28P17035 718 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NR1D1P20393 614 aa6.69□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 ETV3P41162 512 aa6.69□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 FATE1Q969F0 183 aa6.69□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 C9orf72Q96LT7 481 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR2M4Q96R27 311 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 WDR24Q96S15 920 aa6.69□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 GPR87Q9BY21 358 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.69□□□□□ -1.34
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CROTQ9UKG9 612 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SEC16AO15027 2179 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR5K4A6NMS3 321 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CHUKO15111 745 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CCP110O43303 1012 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 VPS4BO75351 444 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PALMO75781 387 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PGLSO95336 258 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 F3P13726 295 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF30P17039 623 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GPD1P21695 349 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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