RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 PEX6Q13608 980 aa21.9■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 SLC9A4Q6AI14 798 aa21.9■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 BORAQ6PGQ7 559 aa21.9■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 SLC30A9Q6PML9 568 aa21.9■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 NAGSQ8N159 534 aa21.9■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 DEF6Q9H4E7 631 aa21.9■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 PCDH9Q9HC56 1237 aa21.9■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.9■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 TTLL3Q9Y4R7 772 aa21.9■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 B4GAT1O43505 415 aa21.89■■□□□ 1.09
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SRRT-218ENST00000620394 MMP2P08253 660 aa21.89■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 VSTM4Q8IW00 320 aa21.89■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 LPCAT1Q8NF37 534 aa21.89■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 LRRN4Q8WUT4 740 aa21.89■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 AGAP2Q99490 1192 aa21.89■■□□□ 1.09
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SRRT-218ENST00000620394 HGSO14964 777 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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SRRT-218ENST00000620394 MFAP3LO75121 409 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ECEL1O95672 775 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ARHGAP25P42331 645 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 GPR3P46089 330 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ZBTB17Q13105 803 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 LRP8Q14114 963 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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SRRT-218ENST00000620394 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 PYCR3Q53H96 274 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 DOK6Q6PKX4 331 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 TRIM74Q86UV6 250 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 CNTD1Q8N815 330 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 OLFM3Q96PB7 478 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 WDR24Q96S15 920 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 SLC12A9Q9BXP2 914 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 SEMA6CQ9H3T2 930 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 VPS18Q9P253 973 aa21.88■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 COL12A1Q99715 3063 aa21.87■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 KCNK1O00180 336 aa21.87■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 CLDN7O95471 211 aa21.87■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ACTR1BP42025 376 aa21.87■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 POLE2P56282 527 aa21.87■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ACTR1AP61163 376 aa21.87■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 QPCTQ16769 361 aa21.87■■□□□ 1.09
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SRRT-218ENST00000620394 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.87■■□□□ 1.09
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SRRT-218ENST00000620394 RHPN2P1A8MT19 583 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 JCHAINP01591 159 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 CD86P42081 329 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 FASLGP48023 281 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 SPINT3P49223 89 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 OR1D5P58170 312 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 KCNAB2Q13303 367 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 TCEAL1Q15170 157 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 PIM3Q86V86 326 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 GALNT13Q8IUC8 556 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 TRIB3Q96RU7 358 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 CHP1Q99653 195 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 RDH14Q9HBH5 336 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa21.86■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 RGSL1A5PLK6 1076 aa21.85■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD66B4E2M5 251 aa21.85■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ZW10O43264 779 aa21.85■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 DNAJC6O75061 913 aa21.85■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 GP1BBP13224 206 aa21.85■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 SQSTM1Q13501 440 aa21.85■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 SLC14A2Q15849 920 aa21.85■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 NUDT22Q9BRQ3 303 aa21.85■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 PKD2L2Q9NZM6 624 aa21.85■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa21.85■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 FADS2P1A8MWK0 482 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 APOL1O14791 398 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 PPM1DO15297 605 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 TPM1P09493 284 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 CCL4P13236 92 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 CD1CP29017 333 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 ALDH4A1P30038 563 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 PDK1Q15118 436 aa21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SRRT-218ENST00000620394 IL22RA1Q8N6P7 574 aa21.84■■□□□ 1.09
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