RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF605Q86T29 641 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 HBEGFQ99075 208 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 ATG13O75143 517 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC1A2P43004 574 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 LCP2Q13094 533 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 ITCHQ96J02 903 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 PPM1MQ96MI6 270 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAJC11Q9NVH1 559 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 C3orf18Q9UK00 162 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 PAICSP22234 425 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXN2P32314 431 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 DPP10Q8N608 796 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 AOC2O75106 756 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 CHN2P52757 468 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 NAE1Q13564 534 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 NUDT14O95848 222 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 DLGAP3O95886 979 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 PRNPP04156 253 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 HLA-DQB2P05538 268 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 ELP6Q0PNE2 266 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 GNA13Q14344 377 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 C17orf64Q86WR6 236 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 SMOQ99835 787 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRJ-208ENST00000615445 CST1P01037 141 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CCR4P51679 360 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PDK3Q15120 406 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA19Q7Z5L4 167 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 DSELQ8IZU8 1212 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 LRTM1Q9HBL6 345 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 A8MUI8 341 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 UBXN8O00124 270 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 AGRPO00253 132 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 TM7SF2O76062 418 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 IFNGR2P38484 337 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 DGCR6Q14129 220 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 OR2T12Q8NG77 320 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ESAMQ96AP7 390 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF358Q9NW07 568 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 TCEA3O75764 348 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ESR1P03372 595 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 NR2F1P10589 423 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC20A2Q08357 652 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 RALGDSQ12967 914 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 MTERF3Q96E29 417 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 SGK2Q9HBY8 427 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 DNM1LO00429 736 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT75O95678 551 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 APODP05090 189 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 VAV1P15498 845 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 HCAR3P49019 387 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGRF1Q5T601 910 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 TPGS2Q68CL5 300 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC103Q8IW40 242 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 VMP1Q96GC9 406 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms