RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 TNFRSF25Q93038 417 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SKA1Q96BD8 255 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LMAN2LQ9H0V9 348 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RASSF1Q9NS23 344 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SNX7Q9UNH6 387 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 GIT1Q9Y2X7 761 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 GNPDA1P46926 289 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 GRIK5Q16478 980 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 VPS26BQ4G0F5 336 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PPM1JQ5JR12 505 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RHBDF2Q6PJF5 856 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RAB43Q86YS6 212 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 IRF2BP1Q8IU81 584 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CLIP3Q96DZ5 547 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 COPS8Q99627 209 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ACSS2Q9NR19 701 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PRG6 482 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PGK1P00558 417 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 KCNA10Q16322 511 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SULT1C3Q6IMI6 304 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 KLHL23Q8NBE8 558 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FCRL4Q96PJ5 515 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PHF12Q96QT6 1004 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ELOVL7A1L3X0 281 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TSPAN9O75954 239 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 GJB1P08034 283 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 IDH3AP50213 366 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 IKBKEQ14164 716 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PPM1MQ96MI6 270 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 MRIQ9BWK5 157 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 C3orf14Q9HBI5 128 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ASAH2Q9NR71 780 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SEMA3GQ9NS98 782 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 STX16O14662 325 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RGS20O76081 388 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LIPEQ05469 1076 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PTP4A2Q12974 167 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 METTL21CQ5VZV1 264 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TRPV1Q8NER1 839 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SPOCK2Q92563 424 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ZNF558Q96NG5 402 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 AP2A2O94973 939 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 GMFBP60983 142 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FBXO42Q6P3S6 717 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LCLAT1Q6UWP7 414 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 MEIOBQ8N635 442 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ZBTB2Q8N680 514 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LEMD2Q8NC56 503 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 HEXDCQ8WVB3 486 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TLCD1Q96CP7 247 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CPXM1Q96SM3 734 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TTLL2Q9BWV7 592 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CCNDBP1O95273 360 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FGBP02675 491 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FSTL1Q12841 308 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CHSY3Q70JA7 882 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RMI1Q9H9A7 625 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PQH9 124 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 DNAJA2O60884 412 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PTGIRP43119 386 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ACAP2Q15057 778 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms