RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	ISCU	Q9H1K1	167 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	KLHL3	Q9UH77	587 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	KCNK6	Q9Y257	313 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909		A6NCN8	305 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PYGL	P06737	847 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ACP5	P13686	325 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MAPK9	P45984	424 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	EPHB1	P54762	984 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	GALNT2	Q10471	571 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	KRT81	Q14533	505 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	IYD	Q6PHW0	289 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MAML1	Q92585	1016 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	VPS18	Q9P253	973 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	COL12A1	Q99715	3063 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SNX2	O60749	519 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	STK17B	O94768	372 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	DLGAP3	O95886	979 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	HLA-DQB2	P05538	268 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CASR	P41180	1078 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ARSE	P51690	589 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	GFER	P55789	205 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	FOXK1	P85037	733 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TYRO3	Q06418	890 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ABHD18	Q0P651	414 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	FAM71B	Q8TC56	605 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	STARD8	Q92502	1023 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	THAP2	Q9H0W7	228 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PTPN13	Q12923	2485 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	MATN3	O15232	486 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	F3	P13726	295 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	F8A1	P23610	371 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	GJC1	P36383	396 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	SPINT3	P49223	89 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF165	P49910	485 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	EPHA4	P54764	986 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	DPYSL3	Q14195	570 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	LYSMD1	Q96S90	227 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	ZPBP	Q9BS86	351 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	OGFR	Q9NZT2	677 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS5-208	ENST00000599909	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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