RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 LMAN1P49257 510 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 ACADVLP49748 655 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 SEMG2Q02383 582 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 GPS1Q13098 491 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 PTK2BQ14289 1009 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 FZD2Q14332 565 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 IRF4Q15306 451 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 PNCKQ6P2M8 343 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 LRRC8BQ6P9F7 803 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 Q6ZVL8 140 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 HOOK3Q86VS8 718 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 JAMLQ86YT9 394 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 MNS1Q8NEH6 495 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 CPT1BQ92523 772 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 PEX13Q92968 403 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 EID2BQ96D98 161 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 SMIM14Q96QK8 99 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 GPR63Q9BZJ6 419 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 IL17CQ9P0M4 197 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 IGF2RP11717 2491 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 FAM149AA5PLN7 773 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 NEMP2A6NFY4 417 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 A8MX80 341 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 H7C0S8 307 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 LDB2O43679 373 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 USP12O75317 370 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 CSF2P04141 144 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 CAPNS1P04632 268 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 GIMD1P0DJR0 217 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 HADHAP40939 763 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 NPY2RP49146 381 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 KIAA1024LP59773 190 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ILKQ13418 452 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 OLIG2Q13516 323 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SPARCL1Q14515 664 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PTPRRQ15256 657 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PROX2Q3B8N5 592 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PARGQ86W56 976 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 OR4C6Q8NH72 309 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ZNF592Q92610 1267 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 AP2M1Q96CW1 435 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 KRT12Q99456 494 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 APOL2Q9BQE5 337 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 TEX101Q9BY14 249 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 IL22Q9GZX6 179 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ABCG8Q9H221 673 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PKP3Q9Y446 797 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 AKAP13Q12802 2813 aa9.83□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 HEATR9A2RTY3 570 aa9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 TRABD2BA6NFA1 517 aa9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 MROH6A6NGR9 719 aa9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 H3BM21 787 aa9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 AURKAO14965 403 aa9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SCAMP1O15126 338 aa9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 FFAR2O15552 330 aa9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 TTI1O43156 1089 aa9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SOD1P00441 154 aa9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PIRTP0C851 137 aa9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ALPPL2P10696 532 aa9.82□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms