RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	COX14	Q96I36	57 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	DTL	Q9NZJ0	730 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743		A0A0G2JNG1	304 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743		J3QKU1	62 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	KCNK1	O00180	336 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	EFS	O43281	561 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	MTA2	O94776	668 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SOD1	P00441	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	GPR89B	P0CG08	455 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SLC1A1	P43005	524 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TAS2R40	P59535	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	HHEX	Q03014	270 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	KIR2DS5	Q14953	304 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PTPRR	Q15256	657 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TGIF1	Q15583	401 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PCSK4	Q6UW60	755 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TRIM74	Q86UV6	250 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PATE1	Q8WXA2	126 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	FAM117A	Q9C073	453 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SNX2	O60749	519 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PRL	P01236	227 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	KRT1	P04264	644 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ETV5	P41161	510 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	EPHA4	P54764	986 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TFDP2	Q14188	446 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	QPCT	Q16769	361 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	LRRC38	Q5VT99	294 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PQLC3	Q8N755	202 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RAPGEF5	Q92565	580 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ART4	Q93070	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ZPBP	Q9BS86	351 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	CARD9	Q9H257	536 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743		A0A0U1RQS6	177 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743		B4E171	279 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	C9orf172	C9J069	976 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	MTSS1	O43312	755 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	GRID2	O43424	1007 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SPOP	O43791	374 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NUAK1	O60285	661 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	DNAJC6	O75061	913 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	THRA	P10827	490 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CCL4	P13236	92 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ACP5	P13686	325 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	VCL	P18206	1134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TSPAN7	P41732	249 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NR2C2	P49116	596 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CDK18	Q07002	472 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SLC14A2	Q15849	920 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms