RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 HHEXQ03014 270 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 GALNT2Q10471 571 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 LRP8Q14114 963 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 EXD1Q8NHP7 514 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 NCSTNQ92542 709 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 GBP4Q96PP9 640 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 WDR24Q96S15 920 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 DPYSL5Q9BPU6 564 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 NUP85Q9BW27 656 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 EPN3Q9H201 632 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ARFGAP3Q9NP61 516 aa15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 FADS2P1A8MWK0 482 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 HLA-DQB2P05538 268 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 RAB15P59190 212 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 NIPAL4Q0D2K0 466 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 COLEC12Q5KU26 742 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 HGSNATQ68CP4 663 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 NIPA2Q8N8Q9 360 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 MAML1Q92585 1016 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ADNPQ9H2P0 1102 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 PDP2Q9P2J9 529 aa15.38■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GTH6 734 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 PYGLP06737 847 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 OAS2P29728 719 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 CCR10P46092 362 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ZNF165P49910 485 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 MC2RQ01718 297 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 DPYSL3Q14195 570 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ALG1LQ6GMV1 187 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 NLGN4XQ8N0W4 816 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 VPS18Q9P253 973 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.37■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 A6NCN8 305 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 MATN3O15232 486 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 STK17BO94768 372 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ARSEP51690 589 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 GFERP55789 205 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 GBE1Q04446 702 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 CDC20Q12834 499 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ALS2CLQ60I27 953 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 IYDQ6PHW0 289 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 NLRP8Q86W28 1048 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 FAM71BQ8TC56 605 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 SLC45A3Q96JT2 553 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 SPRY4Q9C004 299 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 A0A087X0T9 212 aa15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 SLC4A1P02730 911 aa15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 CYP1A2P05177 515 aa15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 FAM228BP0C875 321 aa15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 F3P13726 295 aa15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 CD86P42081 329 aa15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 SPINT3P49223 89 aa15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 GALNT3Q14435 633 aa15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 IGFBP7Q16270 282 aa15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 QPCTQ16769 361 aa15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 DEFB109BQ30KR1 87 aa15.35■□□□□ 0.05
NME3-211ENST00000568561 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms