RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.1□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 VPS18Q9P253 973 aa8.1□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.1□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 PDP2Q9P2J9 529 aa8.1□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 IL17BQ9UHF5 180 aa8.1□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.1□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.1□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.1□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.1□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 KIF26BQ2KJY2 2108 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TENM4Q6N022 2769 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 EFCAB7A8K855 629 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 A8MU76 341 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SUV39H1O43463 412 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 DUX1O43812 170 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 MAP3K6O95382 1288 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 PRLP01236 227 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CD48P09326 243 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 THRAP10827 490 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SLC2A4P14672 509 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ITGB6P18564 788 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 MAN1A1P33908 653 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 UGT1A3P35503 534 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 GJC1P36383 396 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 FASLGP48023 281 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ARSEP51690 589 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 RAB15P59190 212 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 HHEXQ03014 270 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 DPYSL3Q14195 570 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 IQCB1Q15051 598 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 BORAQ6PGQ7 559 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SLC37A2Q8TED4 501 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NCSTNQ92542 709 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SMIM14Q96QK8 99 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ZPBPQ9BS86 351 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
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COCH-211ENST00000557065 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
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COCH-211ENST00000557065 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SPTA1P02549 2419 aa8.09□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 A0A0G2JNG1 304 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 OR5K4A6NMS3 321 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 GRID2O43424 1007 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 MFSD11O43934 449 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SNX2O60749 519 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 DNAJC6O75061 913 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PPFIA2O75334 1257 aa8.08□□□□□ -1.12
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COCH-211ENST00000557065 JCHAINP01591 159 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 H2AFZP0C0S5 128 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CSF2RBP32927 897 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SPINT3P49223 89 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 FANCCQ00597 558 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 MC2RQ01718 297 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 NFATC2Q13469 925 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 IHHQ14623 411 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 KIR2DS5Q14953 304 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ANKS6Q68DC2 871 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 H2AFVQ71UI9 128 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CCDC13Q8IYE1 715 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 AVL9Q8NBF6 648 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 COL26A1Q96A83 441 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 LYSMD1Q96S90 227 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZNF670Q9BS34 389 aa8.08□□□□□ -1.12
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