RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	DVL1	O14640	695 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNN4	O15554	427 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	HCRTR2	O43614	444 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	WDR1	O75083	606 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	MLYCD	O95822	493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	CRYAA	P02489	173 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	CDH1	P12830	882 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAX3	P23760	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ICAM3	P32942	547 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PBX3	P40426	434 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	TTC14	Q96N46	770 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	FGF17	O60258	216 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	CAVIN2	O95810	425 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	CD4	P01730	458 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF23	P17027	643 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	UBA7	P41226	1012 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	GALC	P54803	685 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PHEX	P78562	749 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF234	Q14588	700 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	C1orf226	A1L170	272 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACADM	P11310	421 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	CD53	P19397	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	NR2F2	P24468	414 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	MLLT10	P55197	1068 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	DLX5	P56178	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	MED22	Q15528	200 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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