RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 DPYSL2Q16555 572 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 FAM153CQ494X1 144 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 AHI1Q8N157 1196 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PROCP04070 461 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SSR2P43308 183 aa8.45□□□□□ -1.06
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