RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNG1P51959 295 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC25A3Q00325 362 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAF2Q12933 501 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 EFHBQ8N7U6 833 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 NAT16Q8N8M0 369 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 OTUB2Q96DC9 234 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PHF21BQ96EK2 531 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PFDN6O15212 129 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SMIM24O75264 130 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT34O76011 436 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 BMP1P13497 986 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 IMPDH1P20839 514 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ABL2P42684 1182 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 NXNQ6DKJ4 435 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 KIRREL3Q8IZU9 778 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 VOPP1Q96AW1 172 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TRMOQ9BU70 441 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 HACD3Q9P035 362 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PRSS56P0CW18 603 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 NFKB2Q00653 900 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 DHCR24Q15392 516 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 EML3Q32P44 896 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM215Q68D42 235 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 MYLIPQ8WY64 445 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 LPGAT1Q92604 370 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TAS2R13Q9NYV9 303 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC7A8Q9UHI5 535 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM233B4DJY2 109 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SRP72O76094 671 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 RHOBTB1O94844 696 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP17A1P05093 508 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 THRAP10827 490 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SRCP12931 536 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 FMO4P31512 558 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNC1P48547 511 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SMARCD2Q92925 531 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PTERQ96BW5 349 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 L3HYPDHQ96EM0 354 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 RTKNQ9BST9 563 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A088AWK7 358 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMG1O95456 288 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 JUNP05412 331 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 FCARP24071 287 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 AP1S1P61966 158 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SATB1Q01826 763 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SULT2A1Q06520 285 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CUL3Q13618 768 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRRQ15256 657 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 RCN1Q15293 331 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CUZD1Q86UP6 607 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 STOML1Q9UBI4 398 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ARSAP15289 507 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PIK3R1P27986 724 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 GKP32189 559 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 MC4RP32245 332 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 TTPAP49638 278 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 EPHB1P54762 984 aa20.14■□□□□ 0.81
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