RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 VPS35Q96QK1 796 aa11.16□□□□□ -0.62
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TRAPPC4-211ENST00000533012 UGT1A7Q9HAW7 530 aa11.16□□□□□ -0.62
TRAPPC4-211ENST00000533012 UGT1A10Q9HAW8 530 aa11.16□□□□□ -0.62
TRAPPC4-211ENST00000533012 UGT1A8Q9HAW9 530 aa11.16□□□□□ -0.62
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.14□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11.14□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.14□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 RD3Q7Z3Z2 195 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM135Q86UB9 458 aa11.14□□□□□ -0.63
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