RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 CBX8Q9HC52 389 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SYCE3A1L190 88 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 CLDN7O95471 211 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SERPINC1P01008 464 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 HLA-DQB2P05538 268 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 PYGLP06737 847 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 PBX1P40424 430 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 HHEXQ03014 270 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 FIGNQ5HY92 759 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SNAP47Q5SQN1 464 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 DCAF12Q5T6F0 453 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 EXD1Q8NHP7 514 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ARRDC2Q8TBH0 407 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 VPS18Q9P253 973 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 PDP2Q9P2J9 529 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 TBC1D29Q9UFV1 150 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 KCNK6Q9Y257 313 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 A8MU76 341 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 MATN3O15232 486 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 CYP1A2P05177 515 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 RAB15P59190 212 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 NFATC2Q13469 925 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 CTRCQ99895 268 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 PILRAQ9UKJ1 303 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 A6NCN8 305 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ACP5P13686 325 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 POLE2P56282 527 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 FANCCQ00597 558 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 RTP4Q96DX8 246 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 LYSMD1Q96S90 227 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 A0A087X0T9 212 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM228BP0C875 321 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 GBE1Q04446 702 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 KCNAB2Q13303 367 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 FATE1Q969F0 183 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF670Q9BS34 389 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 A0A1W2PQJ5 194 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 MYO1FO00160 1098 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CA4P22748 312 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CCNCP24863 283 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 MAPK9P45984 424 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SPINT3P49223 89 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 MC2RQ01718 297 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 TLE1Q04724 770 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 NCSTNQ92542 709 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 TSGA13Q96PP4 275 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SPRY4Q9C004 299 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 APMAPQ9HDC9 416 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 AMACRQ9UHK6 382 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SNX2O60749 519 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SERPING1P05155 500 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 MMP2P08253 660 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 CES1P23141 567 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 QPCTQ16769 361 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 IYDQ6PHW0 289 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 NLGN4XQ8N0W4 816 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 PQLC3Q8N755 202 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 FAF2Q96CS3 445 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC45A3Q96JT2 553 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-207ENST00000530513 KLHL3Q9UH77 587 aa22.12■■□□□ 1.13
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