RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.212e-10■□□□□ 9.6
HMBOX1-211ENST00000524238 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 KANK2Q63ZY3 851 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF544Q6NX49 715 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TAS2R42Q7RTR8 314 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 HID1Q8IV36 788 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 EID3Q8N140 333 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM199Q8N511 208 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 OR6B3Q8NGW1 331 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TWIST2Q8WVJ9 160 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 BHMTQ93088 406 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM149B1Q96BN6 582 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TNIP3Q96KP6 325 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SEPHS2Q99611 448 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DSN1Q9H410 356 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TOR3AQ9H497 397 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 NEK6Q9HC98 313 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TM9SF3Q9HD45 589 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ACSS2Q9NR19 701 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ERVW-1Q9UQF0 538 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM234BA2RU67 622 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 C19orf81C9J6K1 198 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 M0QYT0 321 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 GNGT2O14610 69 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 AURKAO14965 403 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 RAD51BO15315 384 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC16A6O15403 523 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CNTN5O94779 1100 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DLGAP3O95886 979 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 HGFP14210 728 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TPH1P17752 444 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CCNCP24863 283 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 S100A5P33763 92 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 HTR7P34969 479 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ADRA1BP35368 520 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CSNK2BP67870 215 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 VAC14Q08AM6 782 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SEMA3BQ13214 749 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CTBP1Q13363 440 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 LRIT3Q3SXY7 679 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF691Q5VV52 312 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ARMCX2Q7L311 632 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 IFNEQ86WN2 208 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DENND6AQ8IWF6 608 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DPP10Q8N608 796 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 C7orf31Q8N865 590 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 AGBL3Q8NEM8 1001 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 RHEBL1Q8TAI7 183 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 FCGR1BQ92637 280 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 PROX1Q92786 737 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 YIPF6Q96EC8 236 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 PHF21BQ96EK2 531 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 KIF12Q96FN5 646 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 C12orf42Q96LP6 360 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC115Q96NT0 180 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.49□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms