RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 SFR1Q86XK3 245 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADSSL1Q8N142 457 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 RASGEF1CQ8N431 466 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 NGEFQ8N5V2 710 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 POC1AQ8NBT0 407 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC38A5Q8WUX1 472 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP6NLQ92738 828 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM149B1Q96BN6 582 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 DUX5Q96PT3 197 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 GAD1Q99259 594 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 SH3GL2Q99962 352 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 TUBA1CQ9BQE3 449 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 EBF2Q9HAK2 575 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCDH9Q9HC56 1237 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 SDF2L1Q9HCN8 221 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM30AQ9NV96 361 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTMR10Q9NXD2 777 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 MCM9Q9NXL9 1143 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR14J1Q9UGF5 321 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 VDAC3Q9Y277 283 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAU2Q9Y6X3 613 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 FRMD3A2A2Y4 597 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 PI4KAP2A4QPH2 592 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM90A26D6RGX4 464 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKRD28O15084 1053 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 SH3BP5O60239 455 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 DOK2O60496 412 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTP4A3O75365 173 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 GJB3O75712 270 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC25A12O75746 678 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 WISP2O76076 250 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF432O94892 652 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR2C1O95371 312 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 LAMP2P13473 410 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 DDX5P17844 614 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNA5P22460 613 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 DGKAP23743 735 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 GARSP41250 739 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIK3CAP42336 1068 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 RXRGP48443 463 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 NIPAL4Q0D2K0 466 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRIK2Q13002 908 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 NAB2Q15742 525 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 DECR1Q16698 335 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 DCST1Q5T197 706 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 C18orf63Q68DL7 685 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLHL35Q6PF15 583 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 ASB18Q6ZVZ8 466 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTC39CQ8N584 583 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR1J2Q8NGS2 313 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR8K5Q8NH50 307 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 HM13Q8TCT9 377 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 CD101Q93033 1021 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIGTQ969N2 578 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 SKA1Q96BD8 255 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 CMTM3Q96MX0 182 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 NODALQ96S42 347 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 MUC13Q9H3R2 512 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 EVA1AQ9H8M9 152 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 UBTD1Q9HAC8 227 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 LTB4R2Q9NPC1 389 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 EHD2Q9NZN4 543 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLHL9Q9P2J3 617 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF69Q9UC07 566 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNG2Q9UJ96 466 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXL2Q9UKC9 423 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 ACSL5Q9ULC5 683 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 AMDHD2Q9Y303 409 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTPRCP08575 1304 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 C5orf60A6NFR6 353 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 LILRA5A6NI73 299 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM178BH3BS89 294 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRID2O43424 1007 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 HCRTR2O43614 444 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 LMX1BO60663 402 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 NDUFS3O75489 264 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 TIPRLO75663 272 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 BAIAP3O94812 1187 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCNDBP1O95273 360 aa2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms