RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 THRAP10827 490 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 MAN1A1P33908 653 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 NOP2P46087 812 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB15P59190 212 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 HHEXQ03014 270 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC9B2Q86UD5 537 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 SFRP1Q8N474 314 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 ARRDC2Q8TBH0 407 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC37A2Q8TED4 501 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 LYSMD1Q96S90 227 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 FUCA2Q9BTY2 467 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 DDA1Q9BW61 102 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 SCN8AQ9UQD0 1980 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 EFCAB7A8K855 629 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 PRLP01236 227 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 JCHAINP01591 159 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 HLA-DQB2P05538 268 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 SPINT3P49223 89 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 NIPAL4Q0D2K0 466 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 TBR1Q16650 682 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 ODF2Q5BJF6 829 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 SNAP47Q5SQN1 464 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 AVL9Q8NBF6 648 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 NCSTNQ92542 709 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 NKD1Q969G9 470 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 HDAC11Q96DB2 347 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 DEF6Q9H4E7 631 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 CLMPQ9H6B4 373 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 PRKAB1Q9Y478 270 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 OR5K4A6NMS3 321 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 A8MU76 341 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 B4E171 279 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 SNX2O60749 519 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJC6O75061 913 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 CASP14P31944 242 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPAN7P41732 249 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 CD86P42081 329 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP4F2P78329 520 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 GBE1Q04446 702 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 NFATC2Q13469 925 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC70Q6NSX1 233 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 IYDQ6PHW0 289 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRN4Q8WUT4 740 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 HERPUD2Q9BSE4 406 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 IFNKQ9P0W0 207 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 MGAQ8IWI9 3026 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 COL6A6A6NMZ7 2263 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP2-220ENST00000511663 GRID2O43424 1007 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 GYPCP04921 128 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM87AP0C7U9 286 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 ACP5P13686 325 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 KDELR1P24390 212 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 CSF2RBP32927 897 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 UGT1A3P35503 534 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 MAPK9P45984 424 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 TAS2R40P59535 323 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 AP1B1Q10567 949 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 MESDQ14696 234 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 QPCTQ16769 361 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 PQLC3Q8N755 202 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 FAF2Q96CS3 445 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF157Q96PX1 679 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA16Q9BXB7 569 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 CARD9Q9H257 536 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 RAD18Q9NS91 495 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 OCIAD1Q9NX40 245 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 DTLQ9NZJ0 730 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM9Q9P0T7 183 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D29Q9UFV1 150 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNK6Q9Y257 313 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 HEY1Q9Y5J3 304 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0G2JNG1 304 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 KIR2DS3K7RE56 304 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNK1O00180 336 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 PPFIA2O75334 1257 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 WISP1O95388 367 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 F3P13726 295 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 IHHQ14623 411 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 KIR2DS5Q14953 304 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC18A3Q16572 532 aa19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms