RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 CTPS1P17812 591 aa10.73□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 HLA-FP30511 346 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 IRS1P35568 1242 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 HNF1BP35680 557 aa10.73□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 TTPAP49638 278 aa10.73□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 FUT11Q495W5 492 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 ZSWIM9Q86XI8 627 aa10.73□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 ECHDC3Q96DC8 303 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR21Q99679 349 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC30A3Q99726 388 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR63Q9BZJ6 419 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 TM6SF2Q9BZW4 377 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP4F12Q9HCS2 524 aa10.73□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 BPIFA1Q9NP55 256 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CD320Q9NPF0 282 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 MAN1C1Q9NR34 630 aa10.73□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 GALPQ9UBC7 116 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM233B4DJY2 109 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BQ06 376 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 PFDN6O15212 129 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 GRM6O15303 877 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 OR1I1O60431 355 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 KERAO60938 352 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 TM7SF2O76062 418 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 PAPLNO95428 1278 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 PYGLP06737 847 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 FGF4P08620 206 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 HERVK_113P63132 956 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 KDSRQ06136 332 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 CERS6Q6ZMG9 384 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 ACAD11Q709F0 780 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 CUZD1Q86UP6 607 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 CEP44Q9C0F1 390 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 TNKS2Q9H2K2 1166 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00597Q9H2U6 94 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 TDP1Q9NUW8 608 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 LMCD1Q9NZU5 365 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D14Q9P2M4 693 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 ZMYM5Q9UJ78 669 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CDYLQ9Y232 598 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 MUC3AQ02505 3323 aa10.72□□□□□ -0.69
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